diff --git a/src/executor/merge.ts b/src/executor/merge.ts
index d8d4439..e4e8533 100644
--- a/src/executor/merge.ts
+++ b/src/executor/merge.ts
@@ -29,7 +29,9 @@ export function mergeWorktreeDirFor(taskId: string): string {
  */
 /**
  * 目标分支正被主检出（repoPath）占用时的合并：直接在主检出里 `git merge --no-ff`。
- * 这是用户手动合并会做的事，安全；但要求工作区干净，否则可能与未提交改动纠缠 → 拒绝。
+ * 这是用户手动合并会做的事，安全；但要求工作区无【已跟踪】的未提交改动，否则可能纠缠 → 拒绝。
+ * 注意：只看已跟踪改动（--untracked-files=no）。未跟踪文件（项目常有的本地杂物 GEMINI.md/.claude/…）
+ * 不算脏——它们不会被合并纠缠；万一某未跟踪文件恰好会被合并覆盖，git merge 会自己报错、走下方 catch。
  */
 async function mergeInPrimaryCheckout(
   repoPath: string,
@@ -37,7 +39,7 @@ async function mergeInPrimaryCheckout(
   defaultBranch: string,
   taskId: string,
 ): Promise<MergeResult> {
-  const dirty = (await git(repoPath, ['status', '--porcelain']).catch(() => '')).trim();
+  const dirty = (await git(repoPath, ['status', '--porcelain', '--untracked-files=no']).catch(() => '')).trim();
   if (dirty) {
     return {
       ok: false,
diff --git a/test/merge.test.ts b/test/merge.test.ts
index 1e8c09c..6c39657 100644
--- a/test/merge.test.ts
+++ b/test/merge.test.ts
@@ -140,6 +140,22 @@ test('mergeBranch：main 被主检出占用但工作区有未提交改动 → 
   assert.equal(gitSync(repo, ['rev-parse', 'main']).trim(), mainBefore, 'main 无损');
 });
 
+test('mergeBranch：main 被主检出占用、仅有未跟踪文件 → 不算脏，仍 in-place 合并成功', async (t) => {
+  const repo = setup(t);
+  gitSync(repo, ['checkout', '-b', 'maestro/tsk_ut']);
+  commitFile(repo, 'a.txt', 'A\n', 'maestro(tsk_ut): add a');
+  gitSync(repo, ['checkout', 'main']);
+  // 主检出有未跟踪文件（项目常见本地杂物，如 GEMINI.md/.claude/…）——不应挡合并
+  writeFileSync(join(repo, 'LOCAL_NOTES.md'), 'untracked junk\n');
+  const mainBefore = gitSync(repo, ['rev-parse', 'main']).trim();
+
+  const r = await mergeBranch(repo, 'maestro/tsk_ut', 'main', 'tsk_ut');
+  assert.equal(r.ok, true, r.error);
+  assert.notEqual(gitSync(repo, ['rev-parse', 'main']).trim(), mainBefore, 'main 应前进');
+  assert.equal(gitSync(repo, ['show', 'main:a.txt']), 'A\n');
+  assert.ok(existsSync(join(repo, 'LOCAL_NOTES.md')), '未跟踪文件应原样保留');
+});
+
 test('mergeBranch：重复合并（分支已在 main 里）→ ok，不新建提交', async (t) => {
   const repo = setup(t);
   gitSync(repo, ['checkout', '-b', 'maestro/tsk_re']);